
Immagina un mondo in cui le malattie, anche le più difficili, possano essere affrontate con un approccio completamente nuovo. Non più solo farmaci tradizionali o interventi invasivi, ma minuscole fabbriche biologiche, create in laboratorio, che lavorano all’interno del nostro corpo per riparare, curare e proteggere. Questa è una realtà che sta emergendo grazie alla biologia sintetica, un campo di studio che sta ridefinendo i confini della medicina.
La biologia sintetica è come un’ingegneria della vita. I ricercatori, con le conoscenze della biologia molecolare, progettano e costruiscono sistemi biologici artificiali, come cellule sintetiche, con funzioni specifiche. Queste cellule non sono “viventi” nel senso tradizionale, ma sono strumenti potenti, capaci di eseguire compiti che le cellule naturali non possono fare o che fanno in modo meno efficiente.
Un approccio dal basso: la costruzione di cellule artificiali
Il processo di creazione di una cellula artificiale è come un gioco di costruzioni, ma a livello molecolare. Si parte da componenti biologici di base, come lipidi, proteine, acidi nucleici, e si assemblano in modo controllato per creare una struttura che imita una cellula. Questo approccio, chiamato “bottom-up”, offre una grande flessibilità, permettendo di progettare cellule con caratteristiche personalizzate.
Esistono due strategie principali per la creazione di cellule artificiali:
- Approccio Top-Down: Si parte da una cellula esistente, semplificandola e rimuovendo le componenti non essenziali per la funzione desiderata.
- Approccio Bottom-Up: Si costruisce la cellula da zero, assemblando molecole biologiche o sintetiche. Le cellule artificiali create con l’approccio bottom-up non hanno un sistema di controllo autonomo, come le cellule naturali, ma sono completamente controllate dal progettista. Questo permette di programmare il loro comportamento in modo preciso, come un micro-robot biologico.
Perché le cellule artificiali sono importanti?
Ci si potrebbe chiedere: “Perché abbiamo bisogno di cellule artificiali? Le cellule naturali non sono sufficienti?” La risposta è che le cellule artificiali offrono vantaggi unici.
- Efficienza: Le cellule artificiali possono essere progettate per svolgere una specifica funzione senza “distrazioni” o interazioni indesiderate, a differenza delle cellule naturali, che svolgono molteplici funzioni contemporaneamente.
- Sicurezza: Le cellule artificiali, essendo non viventi, riducono i problemi di biosicurezza associati all’uso di organismi viventi. Non c’è rischio di rilascio incontrollato nell’ambiente.
- Versatilità: La biologia sintetica permette di creare cellule artificiali con caratteristiche uniche, combinando elementi biologici e sintetici, aprendo un mondo di possibilità.
Applicazioni mediche
Le cellule artificiali hanno un enorme potenziale in campo medico, con applicazioni che spaziano dalla diagnosi alla terapia. Vediamo alcuni esempi concreti:
- Rilascio di farmaci mirato: Le cellule artificiali possono essere utilizzate come “vettori intelligenti” per rilasciare farmaci in modo preciso, direttamente nel sito della malattia. Immagina una capsula microscopica che viaggia attraverso il corpo, riconosce le cellule tumorali e rilascia il farmaco chemioterapico solo in quel punto, risparmiando le cellule sane. Questo riduce gli effetti collaterali e aumenta l’efficacia del trattamento. I liposomi, vescicole composte da lipidi, sono spesso usati come involucro per queste consegne di farmaci.
- Biosensori: Le cellule artificiali possono essere progettate per rilevare specifici biomarcatori di malattia, come proteine o acidi nucleici presenti in quantità anomale in un paziente. Questi biosensori possono fornire una diagnosi precoce e accurata, anche a livello molecolare. In questo caso le cellule artificiali possono essere “programmate” con proteine che reagiscono ad un dato segnale nell’ambiente.
- Produzione di proteine terapeutiche: Le cellule artificiali possono fungere da piccole fabbriche per produrre proteine terapeutiche, come anticorpi o enzimi, direttamente nel corpo del paziente. Questa applicazione potrebbe essere particolarmente utile per curare malattie genetiche o rare, dove è necessario sostituire proteine difettose.
- Terapia genica: Le cellule artificiali possono trasportare materiale genetico (DNA o RNA) all’interno delle cellule del paziente per correggere difetti genetici. Questa applicazione offre un approccio promettente per curare malattie ereditarie o tumori.
- Fotosintesi artificiale: Alcune cellule artificiali sono in grado di svolgere la fotosintesi, utilizzando la luce per produrre energia e composti utili. Questo tipo di cellule potrebbe essere usato per generare energia all’interno del corpo o per produrre farmaci in modo sostenibile.
- Immunoterapia: Le cellule artificiali possono essere utilizzate per stimolare il sistema immunitario del paziente a riconoscere e distruggere le cellule tumorali. Le cellule artificiali possono essere programmate per sintetizzare proteine terapeutiche all’interno dei tumori. Inoltre, possono mimare le cellule del sistema immunitario per indirizzare la terapia.
- Modelli per la ricerca: Le cellule artificiali offrono un modello semplificato per lo studio dei processi cellulari, in particolare nell’ambito della ricerca sull’origine della vita e nel campo della biologia teorica.
Altre applicazioni
Le applicazioni della biologia sintetica non si limitano alla medicina. Le cellule artificiali possono essere utilizzate in molti altri settori, tra cui:
- Biotecnologia Industriale: Le cellule artificiali possono produrre composti chimici, biocarburanti, o materiali innovativi in modo più efficiente e sostenibile rispetto ai metodi tradizionali.
- Biosensori Ambientali: Le cellule artificiali possono rilevare sostanze inquinanti nell’ambiente, fornendo un sistema di allerta precoce per proteggere la salute umana e l’ecosistema.
- Materiali Intelligenti: Le cellule artificiali possono essere utilizzate per creare materiali con proprietà sorprendenti, come la capacità di auto-ripararsi o di adattarsi all’ambiente circostante.
Prospettive future
La biologia sintetica è un campo in rapida evoluzione, con grandi promesse, ma anche con importanti sfide da affrontare.
- Complessità: La costruzione di cellule artificiali complesse, con molteplici funzioni integrate, è un compito difficile che richiede un approccio multidisciplinare e nuove tecnologie.
- Controllo: È necessario trovare modi per controllare il comportamento delle cellule artificiali all’interno del corpo, garantendo che svolgano le loro funzioni in modo sicuro e prevedibile.
- Scalabilità: È necessario sviluppare metodi per produrre cellule artificiali in grandi quantità e a costi contenuti per renderle accessibili a tutti.
- Basi teoriche: La biologia sintetica ha bisogno di maggiori sviluppi nelle basi teoriche per poter avanzare velocemente nello sviluppo di sistemi sempre più complessi e con maggiore autonomia.
- Aspetti etici: È importante riflettere sugli aspetti etici legati alla creazione e all’uso di sistemi biologici artificiali.
Nonostante queste sfide, il futuro della biologia sintetica è luminoso. I ricercatori stanno lavorando con entusiasmo per superare le difficoltà e realizzare il pieno potenziale di questa tecnologia. In futuro, le cellule artificiali potrebbero diventare una parte fondamentale della nostra vita, migliorando la nostra salute e il nostro ambiente.
Biologia sintetica in the news
La biologia sintetica sta compiendo progressi significativi, con recenti sviluppi che evidenziano il suo potenziale in medicina e biotecnologia.
Cellule animali fotosintetiche
Un team di scienziati ha introdotto con successo cloroplasti, gli organelli responsabili della fotosintesi nelle piante, in cellule animali. Utilizzando cloroplasti isolati dall’alga rossa Cyanidioschyzon merolae, capaci di fotosintetizzare a temperature superiori a 37°C, sono riusciti a integrarli in cellule ovariche di criceto cinese. Queste cellule hanno mostrato attività fotosintetica per alcuni giorni, accelerando la loro crescita. Sebbene i cloroplasti importati si siano degradati entro il quarto giorno, questo risultato apre la strada alla creazione di cellule animali artificialmente fotosintetiche, con potenziali applicazioni nella produzione di organi artificiali e carne coltivata in laboratorio.
Geni sintetici per la costruzione di tessuti
Ricercatori dell’Università di Roma Tor Vergata e dell’Università della California, Los Angeles, hanno sviluppato geni sintetici capaci di replicare l’attività delle cellule nella costruzione e smantellamento di strutture molecolari. Utilizzando “mattoncini” di DNA sintetico, hanno creato strutture tubolari controllate da specifiche sequenze di RNA, permettendo la formazione o il disassemblaggio delle strutture in momenti precisi. Questo approccio potrebbe portare a nuove applicazioni in biomedicina e diagnostica, consentendo la progettazione di materiali che evolvono spontaneamente nel tempo.
Comunicazione tra cellule sintetiche e naturali
Un altro avanzamento riguarda la creazione di cellule sintetiche capaci di comunicare con cellule naturali. Queste cellule sintetiche, dotate di organelli artificiali, possono rispondere a stimoli ambientali e scambiare segnali con cellule biologiche. Questa capacità di comunicazione potrebbe rivoluzionare la medicina rigenerativa e la creazione di tessuti ibridi, combinando elementi naturali e sintetici per trattare diverse patologie.
Questi sviluppi sottolineano il rapido avanzamento della biologia sintetica e il suo potenziale nel trasformare approcci terapeutici e biotecnologici.
Punti Chiave da Ricordare:
- La biologia sintetica è un campo che mira a costruire sistemi biologici artificiali con funzioni specifiche.
- Le cellule artificiali sono strumenti potenti per la medicina e la biotecnologia.
- Possono essere progettate con caratteristiche uniche attraverso un approccio “bottom-up”.
- Hanno potenziali applicazioni in diversi campi, come la terapia, la diagnosi, e la produzione di materiali.
- La ricerca in questo campo sta avanzando velocemente, ma è importante affrontare le sfide con un approccio etico e responsabile.
- Le cellule artificiali sono sistemi complessi, ma, allo stesso tempo, semplificati rispetto alle cellule naturali e possono essere usate come modelli per lo studio della biologia teorica e per l’origine della vita.
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Riferimenti bibliografici
- Adamala, Katarzyna P., Martin-Alarcon, Daniel A., Guthrie-Honea, Katriona R., and Boyden, Edward S. 2017. “Engineering Genetic Circuit Interactions within and between Synthetic Minimal Cells.” Nature Chemistry 9 (5): 431–439
- Adiga, Rajani, Al-Adhami, Mustafa, Andar, Abhay, Borhani, Shayan, Brown, Sheniqua, Burgenson, David, Cooper, Merideth A., et al. 2018. “Point-of-Care Production of Therapeutic Proteins of Good-Manufacturing-Practice Quality.” Nature Biomedical Engineering 2 (9): 675–686
- Adiga, Rajani, Andar, Abhay, Borhani, Shayan, Burgenson, David, Deldari, Sevda, Frey, Douglas, Ge, Xudong, et al. 2020. “Manufacturing Biological Medicines on Demand: Safety and Efficacy of Granulocyte Colony-stimulating Factor in a Mouse Model of Total Body Irradiation.” Biotechnology Progress
- Aghdam Abri, Marjan Roya Bagheri, Mosafer Jafar, Baradaran Behzad, Hashemzaei Mahmoud, Baghbanzadeh Amir, de la Guardia Miguel, and Mokhtarzadeh Ahad. 2019. “Recent Advances on Thermosensitive and pH-Sensitive Liposomes Employed in Controlled Release.” Journal of Controlled Release: Official Journal of the Controlled Release Society 315 (December): 1–22
- Aimon, Sophie, Manzi, John, Schmidt, Daniel, Jose Antonio Poveda Larrosa, Patricia Bassereau, and Toombes Gilman E. S. 2011. “Functional Reconstitution of a Voltage-Gated Potassium Channel in Giant Unilamellar Vesicles.” PLoS One 6 (10): e25529
- Allen, Theresa M., and Cullis, Pieter R. 2013. “Liposomal Drug Delivery Systems: From Concept to Clinical Applications.” Advanced Drug Delivery Reviews 65 (1): 36–48
- Altamura, Emiliano, Albanese, Paola, Marotta, Roberto, Milano, Francesco, Fiore, Michele, Trotta, Massimo, Stano, Pasquale, and Mavelli, Fabio. n.d. “Light-Driven ATP Production Promotes mRNA Biosynthesis inside Hybrid Multi-Compartment Artificial Protocells.”
- Altamura, Emiliano, Carrara, P., D’Angelo, F., Mavelli, F., and Stano, P. 2018. “Extrinsic stochastic factors (solute partition) in gene expression inside lipid vesicles and lipid-stabilized water-in-oil droplets: A review.” Synth. Biol. 3
- Amos, M., Dittrich, P., McCaskill, J., and Rasmussen, S. 2011. “Biological and Chemical Information Technologies.” Procedia Comput. Sci. 7, 56–60
- Amstad, Esther, Kohlbrecher, Joachim, Müller, Elisabeth, Schweizer, Thomas, Textor, Marcus, and Reimhult, Erik. 2011. “Triggered Release from Liposomes through Magnetic Actuation of Iron Oxide Nanoparticle Containing Membranes.” Nano Letters 11 (4): 1664–1670
- Anta, J. 2021. “Information, meaning and physics: The intellectual evolution of the English School of Information Theory during 1946-1956.” Sci. Context 34, 357–373
- Ashby, W.R. 1956. An Introduction to Cybernetics; Chapman & Hall Ltd.: London, UK
- Ashby, W.R. 1960. Design for a Brain, 2nd ed.; John Wiley & Sons Inc.: New York, NY, USA
- Ashkenasy, G., Hermans, T.M., Otto, S., and Taylor, A.F. 2017. “Systems chemistry.” Chem. Soc. Rev. 46, 2543–2554
- Atlan, H. 1977. “Sources of Information in Biological Systems.” IFAC Proc. Vol. 10, 177–184
- Atlan, H. 1987. “Self Creation of Meaning.” Phys. Scr. 36, 563–576
- “Activation of the Bacterial Sensor Kinase PhoQ by Acidic pH.” 2007. Molecular Cell 26 (2): 165–174
- Baimanov, Cai, and Chen 2019.
- Baker, BM, Trappmann, B, Wang, WY, Sakar, MS, Kim, IL, Shenoy, VB, Burdick, JA, & Chen, CS 2015, Cell-mediated fibre recruitment drives extracellular matrix mechanosensing in engineered fibrillar microenvironments. Nat. Mater. 14, 1262–1268
- Ball, P. 2005. “Synthetic biology for nanotechnology.” Nanotechnology 16, R1–R8
- Bangham, AD, et al. 1965. “Diffusion of univalent ions across lamellae of swollen phospholipids.” J. Mol. Biol. 13, 238
- Basu, S, et al. 2004. “Spatiotemporal control of gene expression with pulse-generating networks.” Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101, 6355–6360
- Bath, J, et al. 2005. “A free-running DNA motor powered by a nicking enzyme.” Angew. Chem., Int. Ed. 44, 4358–4361
- Baumann, Andreas, Brändli-Baiocco, Annamaria, Cavagnaro, Joy, Dempster, Maggie, Depelchin, B Olympe, Ivens, Inge A., et al. 2014. “PEGylated Biopharmaceuticals: Current Experience and Considerations for Nonclinical Development.” Toxicologic Pathology 43 (7): 959–983
- Beal, J & Rogers, M. 2020. “Levels of autonomy in synthetic biology engineering.” Mol. Syst. Biol. 16, e10019
- Bedau, M.A. 2003. “Artificial life: Organization, adaptation and complexity from the bottom up.” Trends Cogn. Sci. 7, 505–512
- Bedau, M.A., McCaskill, J.S., Packard, N.H., and Rasmussen, S. 2010. “Living technology: Exploiting life’s principles in technology.” Artif. Life 16, 89–97
- Berhanu, Samuel, Ueda, Takuya, and Kuruma, Yutetsu. 2019. “Artificial Photosynthetic Cell Producing Energy for Protein Synthesis.” Nature Communications 10 (1): 1325
- Bertschinger, N., Olbrich, E., Ay, N., and Jost, J. 2008. “Autonomy: An information theoretic perspective.” Biosystems 91, 331–345
- Biner, Olivier, Fedor, Justin G., Yin, Zhan, and Hirst, Judy. 2020. “Bottom-Up Construction of a Minimal System for Cellular Respiration and Energy Regeneration.” ACS Synthetic Biology 9 (6): 1450–1459
- Blake, WJ, et al. 2003. “Noise in eukaryotic gene expression.” Nature (London) 422, 633–637
- Bloch, J, Bachoud-Lévi, AC, Déglon, N, Lefaucheur, JP, Winkel, L, Palfi, S, Nguyen, JP, et al. 2004. “Neuroprotective Gene Therapy for Huntington’s Disease, Using Polymer-Encapsulated Cells Engineered to Secrete Human Ciliary Neurotrophic Factor: Results of a Phase I Study.” Human Gene Therapy 15 (10): 968–975
- Boyer, Cecile, and Zasadzinski, Joseph A. 2007. “Multiple Lipid Compartments Slow Vesicle Contents Release in Lipases and Serum.” ACS Nano 1 (3): 176–182
- Braccini, M., Collinson, E., Roli, A., Fellermann, H., and Stano, P. 2023. “Recurrent neural networks in synthetic cells: a route to autonomous molecular agents?” Front. Bioeng. Biotechnol. 11, 1210334
- Brillouin, L. 1962. Science and Information Theory, 2nd ed.; Academic Press, Inc.: New York, NY, USA
- Buxboim, A, et al. 2007. “A single-step photolithographic interface for cell-free gene expression and active biochips.” Small 3, 500–510
- Cariani, P. 1993. “To evolve an ear. Epistemological implications of Gordon Pask’s electrochemical devices.” Syst. Res. 10, 19–33
- Carnap, R., and Bar-Hillel, Y. 1953. “An outline of a theory of semantic information.” Brit. J. Phil. Sci. 4, 147–157
- Carter, Kevin A., Shao, Shuai, Hoopes, Matthew I., Luo, Dandan, Ahsan, Bilal, Grigoryants, Vladimir M., Song, Wentao, et al. 2014. “Porphyrin–phospholipid Liposomes Permeabilized by near-Infrared Light.” Nature Communications
- Caschera, Filippo, and Noireaux, Vincent. 2015. “A Cost-Effective Polyphosphate-Based Metabolism Fuels an All E. Coli Cell-Free Expression System.” Metabolic Engineering
- Cattaneo, MV, and Chang, TM. 1991. “The Potential of a Microencapsulated Urease-Zeolite Oral Sorbent for the Removal of Urea in Uremia.” ASAIO Transactions / American Society for Artificial Internal Organs 37 (2): 80–87
- Čejková, J., and Cartwright, J.H.E. 2022. “Chemobrionics and Systems Chemistry.” ChemSystemsChem 4, e202200002
- “Cell-Free Expression and Assembly of ATP Synthase.” 2011. Journal of Molecular Biology 413 (3): 593–603
- Center for Drug Evaluation, and Research. 2019. “Emerging Technology Program.” October 10, 2019.
- Chang, Hao-Nan, Liu, Bei-Yuan, Qi, Yun-Kun, Zhou, Yang, Chen, Yan-Ping, Pan, Kai-Mai, Li, Wen-Wen, et al. 2015. “Blocking of the PD-1/PD-L1 Interaction by a D-Peptide Antagonist for Cancer Immunotherapy.” Angewandte Chemie 54 (40): 11760–11764
- Chang, T.M. 1964. “Semipermeable microcapsules.” Science 146, 524–525
- Chang, T.M. 1967. “Microcapsules as artificial cells.” Sci. J. 3, 62
- Chang, T.M. 1972. Artificial Cells; Charles C. Thomas: Springfield, IL, USA
- Chang, T.M. 2000. “Artificial cell biotechnology for medical applications.” Blood Purif. 18, 91–96
- Chang, Thomas Ming Swi. 2005. “Therapeutic Applications of Polymeric Artificial Cells.” Nature Reviews Drug Discovery
- Chang, Thomas Ming Swi. 2019. “ARTIFICIAL CELL Evolves into Nanomedicine, Biotherapeutics, Blood Substitutes, Drug Delivery, Enzyme/gene Therapy, Cancer Therapy, Cell/stem Cell Therapy, Nanoparticles, Liposomes, Bioencapsulation, Replicating Synthetic Cells, Cell Encapsulation/ scaffold, Biosorbent/immunosorbent Haemoperfusion/plasmapheresis, Regenerative Medicine, Encapsulated Microbe, Nanobiotechnology, Nanotechnology.” Artificial Cells, Nanomedicine, and Biotechnology 47 (1): 997–1013
- Chen, JH, and Seeman, NC. 1991. “Synthesis from DNA of a molecule with the connectivity of a cube.” Nature (London) 350, 631–633
- Chi, Yingying, Yin, Xuelei, Sun, Kaoxiang, Feng, Shuaishuai, Liu, Jinhu, Chen, Daquan, Guo, Chuanyou, and Wu, Zimei. 2017. “Redox-Sensitive and Hyaluronic Acid Functionalized Liposomes for Cytoplasmic Drug Delivery to Osteosarcoma in Animal Models.” Journal of Controlled Release: Official Journal of the Controlled Release Society 261 (September): 113–125
- Chin, JW. 2006. “Modular approaches to expanding the functions of living matter.” Nat. Chem. Biol. 2, 304–311
- Choi, Hyo-Jick, and Montemagno, Carlo D. 2005. “Artificial Organelle: ATP Synthesis from Cellular Mimetic Polymersomes.” Nano Letters
- Chworos, A, et al. 2004. “Building programmable jigsaw puzzles with RNA.” Science 306, 2068–2072
- Cronin, L., Krasnogor, N., Davis, B.G., Alexander, C., Robertson, N., Steinke, J.H.G., Schroeder, S.L.M., Khlobystov, A.N., Cooper, G., Gardner, P.M., et al. 2006. “The imitation game–a computational chemical approach to recognizing life.” Nat. Biotechnol. 24, 1203–1206
- Damiano, L., and Stano, P. 2018. “Synthetic Biology and Artificial Intelligence. Grounding a cross-disciplinary approach to the synthetic exploration of (embodied) cognition.” Complex Syst. 27, 199–228
- Damiano, L., and Stano, P. 2020. “On the “Life-Likeness” of Synthetic Cells.” Front. Bioeng. Biotechnol. 8, 953
- Damiano, L., and Stano, P. 2021. “A Wetware Embodied AI? Towards an Autopoietic Organizational Approach Grounded in Synthetic Biology.” Front. Bioeng. Biotechnol. 9, 873
- Damiano, L., and Stano, P. 2023. “Explorative Synthetic Biology in AI. Criteria of relevance and a taxonomy for synthetic models of living and cognitive processes.” Artif. Life 29, 367–387
- Danhier 2016.
- de Almeida, P, Jaspers, M, Vaessen, S, Tagit, O, Portale, G, Rowan, AE & Kouwer, PHJ. 2019. “Cytoskeletal stiffening in synthetic hydrogels.” Nat. Commun. 10, 609
- de Lorenzo, V., and Danchin, A. 2008. “Synthetic biology: discovering new worlds and new words.” EMBO Rep. 9, 822–827
- Del Moro, L., Magarini, M., and Stano, P. 2024. “On the Evaluation of Observed Semantic Information in Synthetic Cells.” In Proceedings of the Artificial Life and Evolutionary Computation, WIVACE 2023, Venice, Italy, 6–8 September 2023; Communications in Computer and Information Science; Serra, R., Villani, M., Cagnoni, S., Eds.; Springer Nature Switzerland: Cham, Switzerland
- Del Moro, L., Ruzzante, B., Magarini, M., Gentili, P.L., Rampioni, G., Roli, A., Damiano, L., and Stano, P. 2023. “Chemical Neural Networks and Semantic Information Investigated Through Synthetic Cells.” In Proceedings of the Artificial Life and Evolutionary Computation, WIVACE 2022, Gaeta, Italy, 14–16 September 2022; Communications in Computer and Information Science; De Stefano, C., Fontanella, F., Vanneschi, L., Eds.; Springer Nature Switzerland: Cham, Switzerland
- Deplazes-Zemp, A. 2016. “Artificial cell research as a field that connects chemical, biological and philosophical questions.” Chimia 70, 443–448
- Deshpande, Siddharth, Caspi, Yaron, Meijering, Anna E. C., and Dekker, Cees. 2016. “Octanol-Assisted Liposome Assembly on Chip.” Nature Communications 7 (January): 10447
- Deshpande, Siddharth, Spoelstra, Willem Kasper, van Doorn, Marleen, Kerssemakers, Jacob, and Dekker, Cees. 2018. “Mechanical Division of Cell-Sized Liposomes.” ACS Nano 12 (3): 2560–2568
- Dhir, Satarupa, Salahub, Sumalee, Anu, Stella Mathews Surjith Kumar Kumaran, Montemagno, Carlo D., and Abraham, Sinoj. 2018. “Light-Induced ATP Driven Self-Assembly of Actin and Heavy-Meromyosin in Proteo-Tubularsomes as a Step toward Artificial Cells.” Chemical Communications 54 (42): 5346–5349
- Di Paolo, E.A. 2003. “Organismically inspired robotics: Homeostatic adaptation and teleology beyond the closed sensorimotor loop.” In Dynamical Systems Approach to Embodiment and Sociality; Murase, K., Asakura, T., Eds.; Advanced Knowledge International: Adelaide, Australia, pp. 19–42
- Dimova, R., Stano, P., Marques, C.M., and Walde, P. 2020. “Preparation methods for giant unilamellar vesicles.” In The Giant Vesicle Book; Dimova, R., Marques, C.M., Eds.; Taylor & Francis Group: Boca Raton, FL, USA, pp. 3–20
- Ding, Yudi, Williams, Nicholas H., and Hunter, Christopher A. 2019. “A Synthetic Vesicle-to-Vesicle Communication System.” Journal of the American Chemical Society 141 (44): 17847–17853
- Dittrich, Petra S., Heule, Martin, Renaud, Philippe, and Manz, Andreas. 2006. “On-Chip Extrusion of Lipid Vesicles and Tubes through Microsized Apertures.” Lab on a Chip 6 (4): 488–493
- Doktorova, Milka, Heberle, Frederick A., Eicher, Barbara, Standaert, Robert F., Katsaras, John, London, Erwin, Pabst, Georg, and Marquardt, Drew. 2018. “Preparation of Asymmetric Phospholipid Vesicles for Use as Cell Membrane Models.” Nature Protocols 13 (9): 2086–2101
- Fatouros, Dimitrios G., Lamprou, Dimitrios A., Urquhart, Andrew J., Yannopoulos, Spyros N., Vizirianakis, Ioannis S., Zhang, Shuguang, and Koutsopoulos, Sotirios. 2014. “Lipid-like Self-Assembling Peptide Nanovesicles for Drug Delivery.” ACS Applied Materials & Interfaces 6 (11): 8184–8189
- Fang, Islam, and Maeda 2020.
- Feng, Shuaishuai, Wu, Zi-Xin, Zhao, Ziyan, Liu, Jinhu, Sun, Kaoxiang, Guo, Chuanyou, Wang, Hongbo, and Wu, Zimei. 2019. “Engineering of Bone- and CD44-Dual-Targeting Redox-Sensitive Liposomes for the Treatment of Orthotopic Osteosarcoma.” ACS Applied Materials & Interfaces 11 (7): 7357–7368
- Feng, Xiyun, Jia, Yi, Cai, Peng, Fei, Jinbo, and Li, Junbai. 2016. “Coassembly of Photosystem II and ATPase as Artificial Chloroplast for Light-Driven ATP Synthesis.” ACS Nano 10 (1): 556–561
- Ferreira, SA, Motwani, MS, Faull, PA, Seymour, AJ, Yu, TTL, Enayati, M, Taheem, DK, Salzlechner, C, Haghighi, T, Kania, EM, Oommen, OP, Ahmed, T, Loaiza, S, Parzych, K, Dazzi, F, Varghese, OP, Festy, F, Grigoriadis, AE, Auner, HW, Snijders, AP, Bozec, L & Gentleman, E. 2018. “Bi-directional cell-pericellular matrix interactions direct stem cell fate.” Nat. Commun. 9
- Fields, C., and Levin, M. 2020. “How Do Living Systems Create Meaning?” Philosophies 5, 36
- Floridi, L. 2011. The Philosophy of Information; Oxford University Press: Oxford, UK
- Froese, T., and Ziemke, T. 2009. “Enactive artificial intelligence: Investigating the systemic organization of life and mind.” Artif. Intell. 173, 466–500
- Fujii, S., Matsuura, T., Sunami, T., Nishikawa, T., Kazuta, Y., and Yomo, T. 2014. “Liposome display for in vitro selection and evolution of membrane proteins.” Nat. Protoc. 9, 1578–1591
- Garenne, D, Libchaber, A & Noireaux, V. 2020. “Membrane molecular crowding enhances MreB polymerization to shape synthetic cells from spheres to rods.” Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A 117, 1902–1909
- Gardner, P.M., Winzer, K., and Davis, B.G. 2009. “Sugar synthesis in a protocellular model leads to a cell signalling response in bacteria.” Nat. Chem. 1, 377–383
- Gentili, P.L. 2013. “Small steps towards the development of chemical artificial intelligent systems.” RSC Adv. 3, 25523–25549
- Gentili, P.L., and Stano, P. 2022. “Chemical Neural Networks Inside Synthetic Cells? A Proposal for Their Realization and Modeling.” Front. Bioeng. Biotechnol. 10, 927110
- Giulimondi et al. 2019.
- Goodman, et al. 2005.
- Green, ML, Choi, CL, Hattrick-Simpers, JR, Joshi, AM, Takeuchi, I, Barron, SC, Campo, E, Chiang, T, Empedocles, S, Gregoire, JM, Kusne, AG, Martin, J, Mehta, A, Persson, K, Trautt, Z, Van Duren, J & Zakutayev, A. 2017. “Fulfilling the promise of the materials genome initiative with high-throughput experimental methodologies.” Appl. Phys. Rev. 4, 011105
- Grubbe, William S., Rasor, Blake J., Krüger, Antje, Jewett, Michael C., and Karim, Ashty S. 2020. “Cell-Free Styrene Biosynthesis at High Titers.” Metabolic Engineering 61 (September): 89–95
- Gu, Kang Fu, and Chang, Thomas Ming Swi. 1990. “Conversion of Ammonia or Urea into Essential Amino Acids, L-Leucine, L-Valine, and L-Isoleucine Using Artificial Cells Containing an Immobilized Multienzyme System and Dextran-NAD.” Journal of Molecular Catalysis
- Guidoni, A. 2018. Verso il Robot Sapiens, 1st ed.; Collana Scienza, Edizioni Controluce: Monte Compatri, Italy
- Haller, Barbara, Kerstin Göpfrich Martin Schröter, Janiesch Jan-Willi, Platzman Ilia, and Spatz, Joachim P. 2018. “Charge-Controlled Microfluidic Formation of Lipid-Based Single- and Multicompartment Systems.” Lab on a Chip 18 (17): 2665–2674
- Hanczyc, M.M. 2009. “The Early History of Protocells – The search for the recipe of life.” In Protocells: Bridging Nonliving and Living Matter; Rasmussen, S., Bedau, M.A., Chen, L., Deamer, D., Krakauer, D.C., Packard, N.H., Eds.; MIT Press: Cambridge MA, USA, pp. 3–18
- Harnad, S. 1990. “The symbol-grounding problem.” Phys. D Nonlinear Phenom. 42, 335–346
- Hayles, N.K. 1999. How We Became Posthuman. Virtual Bodies in Cybernetics, Literature, and Informatics; The University of Chicago Press: Chicago, IL, USA; London, UK
- He, Haisheng, Lu, Yi, Qi, Jianping, Zhu, Quangang, Chen, Zhongjian, and Wu, Wei. 2019. “Adapting Liposomes for Oral Drug Delivery.” Acta Pharmaceutica Sinica. B 9 (1): 36–48
- Hoffmann, P.M. 2012. Life’s Ratchet. How Molecular Machines Extract Order from Chaos, 1st ed.; Basic Books. A Member of the Perseus Books Group: New York, NY, USA
- Hörner, M, Raute, K, Hummel, B, Madl, J, Creusen, G, Thomas, OS, Christen, EH, Hotz, N, Gübeli, RJ, Engesser, R, Rebmann, B, Lauer, J, Rolauffs, B, Timmer, J, Schamel, WWA, Pruszak, J, Rümer, W, Zurbriggen, MD, Friedrich, C, Walther, A, Minguet, S, Sawarkar, R & Weber, W. 2019. “Phytochrome-Based Extracellular Matrix with Reversibly Tunable Mechanical Properties.” Adv. Mater 31, e1806727
- Hortelão, Ana C., Sonia García‐Jimeno Mary Cano‐Sarabia, Tania Patiño Daniel Maspoch, and Sanchez Samuel. 2020. “LipoBots: Using Liposomal Vesicles as Protective Shell of Urease‐Based Nanomotors.” Advanced Functional Materials
- Hu, Quanyin, Sun, Wujin, Qian, Chengen, Wang, Chao, Bomba, Hunter N., and Gu, Zhen. 2015. “Anticancer Platelet-Mimicking Nanovehicles.” Advanced Materials 27 (44): 7043–7050
- Hu, Yumiao, and Qiu, Liyan. 2019. “Polymersomes: Preparation and Characterization.” In Pharmaceutical Nanotechnology: Basic Protocols, edited by Weissig Volkmar and Elbayoumi Tamer, 247–265. New York, NY: Springer New York
- Hutchison, C.A.; Chuang, R.Y.; Noskov, V.N.; Assad-Garcia, N.; Deerinck, T.J.; Ellisman, M.H.; Gill, J.; Kannan, K.; Karas, B.J.; Ma, L.; et al. 2016. “Design and synthesis of a minimal bacterial genome.” Science 351, aad6253
- Ito, Yoko, Nakagawa, Shoko, Komagata, Ayako, Masao Ikeda-Saito Yoshitsugu Shiro, and Nakamura, Hiro. 2009. “Heme-Dependent Autophosphorylation of a Heme Sensor Kinase, ChrS, from Corynebacterium Diphtheriae Reconstituted in Proteoliposomes.” FEBS Letters 583 (13): 2244–2248
- Ivens, Inge A., Achanzar, William, Baumann, Andreas, Brändli-Baiocco, Annamaria, Cavagnaro, Joy, Dempster, Maggie, Depelchin, B. Olympe, et al. 2015. “PEGylated Biopharmaceuticals: Current Experience and Considerations for Nonclinical Development.” Toxicologic Pathology 43 (7): 959–983
- Iyer, Rohin K., Bowles, Paul A., Kim, Howard, and Dulgar-Tulloch, Aaron. 2018. “Industrializing Autologous Adoptive Immunotherapies: Manufacturing Advances and Challenges.” Frontiers of Medicine 5 (May): 150
- Iyer, Sukanya, Karig, David K., Norred, S. Elizabeth, Simpson, Michael L., and Doktycz, Mitchel J. 2013. “Multi-Input Regulation and Logic with T7 Promoters in Cells and Cell-Free Systems.” PloS One 8 (10): e78442
- Jaeger, L, and Chworos, A. 2006. “The architectonics of programmable RNA and DNA nanostructures.” Curr. Opin. Struct. Biol. 16, 531
- Jahn, Andreas, Vreeland, Wyatt N., Gaitan, Michael, and Locascio, Laurie E. 2004. “Controlled Vesicle Self-Assembly in Microfluidic Channels with Hydrodynamic Focusing.” Journal of the American Chemical Society 126 (9): 2674–2675
- Jermutus, L, et al. 1998. “Recent advances in producing and selecting functional proteins by using cell-free translation.” Curr. Opin. Biotechnol. 9, 534–548
- Joyce, GF. 2007. “Forty years of in vitro evolution.” Angew. Chem., Int. Ed.
- Kan, A & Joshi, NS. 2019. “Towards the directed evolution of protein materials.” MRS Commun. 9, 441–455
- Kauffman, S, and Ellington, AD. 1999. “Thinking combinatorially.” Curr. Opin. Chem. Biol. 3, 256–259
- Kim, J, et al. 2004. “Neural network computation by in vitro transcriptional circuits.” Adv. Neural Inf. Process. Syst. 17, 681–688
- Kim, Min Woo, Niidome, Takuro, and Lee, Ruda. 2019. “Glycol Chitosan-Docosahexaenoic Acid Liposomes for Drug Delivery: Synergistic Effect of Doxorubicin-Rapamycin in Drug-Resistant Breast Cancer.” Marine Drugs 17 (10)
- Kisovec, Matic, Rezelj, Saša, Knap, Primož, Mojca, Cajnko Miša, Caserman, Simon, Flašker, Ajda, Žnidaršič, Nada, et al. 2017. “Engineering a pH Responsive Pore Forming Protein.” Scientific Reports
- Kiverstein, J., Kirchhoff, M.D., and Froese, T. 2022. “The Problem of Meaning: The Free Energy Principle and Artificial Agency.” Front. Neurorobot. 16, 8447